Neben zahlreichen, mit Architekturpreisen ausgezeichneten und vielfach veröffentlichten Bauprojekten, hat Johannes Schilling kontinuierlich komplexe städtebauliche Aufgaben und Themenstellungen bearbeitet.

Diese beziehen sich häufig auf Umstrukturierungs-, konvertierungs- und Revitalisierungsmaßnahmen ehemals industriell genutzter Flächen. Derzeit bearbeiten Schilling Architekten beispielsweise das Gelände der ehemaligen Dupont Fabrik (Entwurf, Bauleitplanung) oder das Gelände der Sidol Werke (Entwurf, städtebauliche Begleitung der Umsetzung) in Köln mit teilweise denkmalgeschütztem Industriebaubestand. Wie in vielen Fällen, sind auch diese Aufgaben das Ergebnis gewonnener Wettbewerbsverfahren.

Darüber hinaus hat Johannes Schilling in vielen städtebaulichen und architektonischen Wettbewerbs- und Konkurrenzverfahren als Preisrichter oder Berater mitgewirkt.

In seiner Funktion als Vorsitzender des Gestaltungsbeirats der Stadt Köln hat er sich intensiv mit der Initiierung und Moderation langfristiger Strategien für im Wandel befindliche Stadtgebiete beschäftigt.

Derzeit ist Johannes Schilling Mitglied im Beirat für Stadtgestaltung der Stadt Münster.